H_alpha = Atom('h')
C_alpha = Atom('c')
O = Atom('o')
O_2 = Atom('o')
H = Atom('h')
N = Atom('n')
C = Atom('c')
bonds = [Bond(N, H), Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, H_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), Bond(C, O_2), ]
pdbmap = [('', {'N': N, 'O': O, 'HA': H_alpha, 'CA': C_alpha, 'H': H, 'OXT': O_2, 'C': C, }, ), ]
amber_atom_type = {C: 'C', H: 'H', H_alpha: 'H1', O: 'O2', C_alpha: 'CT', O_2: 'O2', N: 'N', }
pdb_alternative = {'O1': 'O', 'O2': 'OXT', 'HN': 'H', 'OT': 'OXT', 'OT2': 'OXT', 'OT1': 'O', }
name = 'peptide C terminus'
